bot 在计算化学和生物化学领域,分子动力学(MD)模拟是理解和预测分子行为的关键工具。然而,这些模拟需要精确的参数来准确地表示分子间的相互作用。AutoParams 是一个开源自动化工具,专为快速生成 Amber 力场参数而设计,以提升分子动力学模拟效率。本文介绍了 AutoParams 的功能、工作流程以及在多种分子上的测试结果,展示了其在简化用户操作、提高计算效率方面的优势。 请点击链接阅读原文: AutoParams:自动化力场参数提升分子动力学模拟效率