不仅哺乳动物有蛋白降解靶向嵌合体（PROTAC），植物也有复杂的蛋白互作网络。
近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队创制了植物中首个E3泛素连接酶（UbE3）文库用于泛素化互作组鉴定，并利用该文库鉴定了苯丙氨酶家族蛋白PALs的核心E3泛素连接酶OsFBK16，揭示OsFBK16通过降解OsPALs负调控稻瘟病抗性的分子机制。相关研究论文发表于《基因组生物学》。
泛素化修饰是真核生物体内最重要的蛋白翻译后修饰之一，在蛋白降解、细胞周期调节、转录调控和信号转导等多个细胞学过程中发挥关键作用。鉴定E3泛素连接酶及其泛素化底物是泛素化修饰研究的重点和难点。过去10年的研究，利用特异识别泛素化位点的单克隆抗体等方法在动植物中鉴定到了大量泛素化蛋白，但由于缺乏系统的E3泛素连接酶鉴定体系，绝大多数泛素化蛋白相对应的E3泛素连接酶都不清楚。
为了创制高效的E3泛素连接酶鉴定体系，该研究对水稻中的1515个E3泛素连接酶基因（占水稻基因总数的4.73%）进行了系统分析。通过PCR扩增和大规模基因合成获得了1499个E3泛素连接酶的全长编码序列（覆盖泛素连接酶的98.94%），并以此创制了均一化的水稻UbE3文库。
为了验证UbE3文库的有效性，该研究首先对已报道的分别参与水稻干旱、高盐和抗病等生物学过程的关键泛素化蛋白进行了筛选，结果表明利用UbE3文库可以高效鉴定已报道的和新的E3泛素连接酶。
该研究构建的UbE3文库是植物中第一个完整的E3泛素连接酶文库，提供了强大的蛋白组学资源，为构建“E3泛素连接酶—泛素化蛋白”互作组奠定了重要基础。由于泛素化修饰在真核生物中的重要性和保守性，该文库对其他物种也具有重要的参考和应用价值。